Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CubnQ9JLB4 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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