Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gde1Q9JL56 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms