Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ybx3Q9JKB3 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms