Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS0

Scube2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scube2Q9JJS0 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Scube2Q9JJS0 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Scube2Q9JJS0 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Scube2Q9JJS0 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scube2Q9JJS0 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scube2Q9JJS0 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scube2Q9JJS0 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scube2Q9JJS0 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scube2Q9JJS0 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scube2Q9JJS0 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scube2Q9JJS0 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scube2Q9JJS0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scube2Q9JJS0 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scube2Q9JJS0 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Scube2Q9JJS0 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scube2Q9JJS0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scube2Q9JJS0 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scube2Q9JJS0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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