Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Trim39Q9ESN2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Trim39Q9ESN2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Trim39Q9ESN2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Trim39Q9ESN2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Trim39Q9ESN2 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Trim39Q9ESN2 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Trim39Q9ESN2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Trim39Q9ESN2 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Trim39Q9ESN2 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Trim39Q9ESN2 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Trim39Q9ESN2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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