Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ush1cQ9ES64 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ush1cQ9ES64 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ush1cQ9ES64 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ush1cQ9ES64 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ush1cQ9ES64 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ush1cQ9ES64 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ush1cQ9ES64 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ush1cQ9ES64 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ush1cQ9ES64 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ush1cQ9ES64 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ush1cQ9ES64 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ush1cQ9ES64 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ush1cQ9ES64 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ush1cQ9ES64 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ush1cQ9ES64 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ush1cQ9ES64 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ush1cQ9ES64 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ush1cQ9ES64 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ush1cQ9ES64 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms