Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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