Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms