Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgshQ9EQ08 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms