Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Med27Q9DB40 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Med27Q9DB40 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Med27Q9DB40 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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