Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB38

Znf580, Zinc finger protein 580, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf580Q9DB38 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Znf580Q9DB38 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf580Q9DB38 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf580Q9DB38 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf580Q9DB38 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Znf580Q9DB38 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf580Q9DB38 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf580Q9DB38 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf580Q9DB38 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf580Q9DB38 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Znf580Q9DB38 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Znf580Q9DB38 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf580Q9DB38 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf580Q9DB38 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf580Q9DB38 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Znf580Q9DB38 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf580Q9DB38 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Znf580Q9DB38 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Znf580Q9DB38 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Znf580Q9DB38 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Znf580Q9DB38 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Znf580Q9DB38 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Znf580Q9DB38 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Znf580Q9DB38 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Znf580Q9DB38 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Znf580Q9DB38 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Znf580Q9DB38 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Znf580Q9DB38 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Znf580Q9DB38 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Znf580Q9DB38 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Znf580Q9DB38 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Znf580Q9DB38 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Znf580Q9DB38 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Znf580Q9DB38 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Znf580Q9DB38 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Znf580Q9DB38 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Znf580Q9DB38 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Znf580Q9DB38 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Znf580Q9DB38 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Znf580Q9DB38 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Znf580Q9DB38 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms