Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Snx5Q9D8U8 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Snx5Q9D8U8 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Snx5Q9D8U8 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Snx5Q9D8U8 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx5Q9D8U8 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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