Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Capn9Q9D805 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn9Q9D805 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn9Q9D805 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Capn9Q9D805 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Capn9Q9D805 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn9Q9D805 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn9Q9D805 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Capn9Q9D805 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Capn9Q9D805 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn9Q9D805 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capn9Q9D805 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn9Q9D805 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms