Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl40Q9D783 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms