Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Ptp4a3Q9D658 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptp4a3Q9D658 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptp4a3Q9D658 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptp4a3Q9D658 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptp4a3Q9D658 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptp4a3Q9D658 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptp4a3Q9D658 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptp4a3Q9D658 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptp4a3Q9D658 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptp4a3Q9D658 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptp4a3Q9D658 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptp4a3Q9D658 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptp4a3Q9D658 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptp4a3Q9D658 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptp4a3Q9D658 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptp4a3Q9D658 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptp4a3Q9D658 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptp4a3Q9D658 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptp4a3Q9D658 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptp4a3Q9D658 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptp4a3Q9D658 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptp4a3Q9D658 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptp4a3Q9D658 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptp4a3Q9D658 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptp4a3Q9D658 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptp4a3Q9D658 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptp4a3Q9D658 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptp4a3Q9D658 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptp4a3Q9D658 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptp4a3Q9D658 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptp4a3Q9D658 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptp4a3Q9D658 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptp4a3Q9D658 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms