Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc6Q9D4E6 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
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