Protein–RNA interactions for Protein: Q9D350

Obox1, OBOX1, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox1Q9D350 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Obox1Q9D350 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Obox1Q9D350 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Obox1Q9D350 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Obox1Q9D350 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Obox1Q9D350 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Obox1Q9D350 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Obox1Q9D350 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Obox1Q9D350 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Obox1Q9D350 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Obox1Q9D350 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Obox1Q9D350 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Obox1Q9D350 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Obox1Q9D350 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Obox1Q9D350 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Obox1Q9D350 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Obox1Q9D350 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Obox1Q9D350 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Obox1Q9D350 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Obox1Q9D350 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Obox1Q9D350 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Obox1Q9D350 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Obox1Q9D350 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Obox1Q9D350 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Obox1Q9D350 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Obox1Q9D350 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Obox1Q9D350 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Obox1Q9D350 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Obox1Q9D350 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Obox1Q9D350 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Obox1Q9D350 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Obox1Q9D350 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Obox1Q9D350 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Obox1Q9D350 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Obox1Q9D350 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Obox1Q9D350 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Obox1Q9D350 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Obox1Q9D350 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms