Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms