Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syf2Q9D198 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms