Protein–RNA interactions for Protein: Q9D174

Ss18l2, SS18-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l2Q9D174 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ss18l2Q9D174 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms