Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gtf2e1Q9D0D5 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms