Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

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Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snf8Q9CZ28 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snf8Q9CZ28 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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