Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX9

Ddx47, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddx47Q9CWX9 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx47Q9CWX9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ddx47Q9CWX9 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ddx47Q9CWX9 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ddx47Q9CWX9 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ddx47Q9CWX9 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ddx47Q9CWX9 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx47Q9CWX9 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ddx47Q9CWX9 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Ddx47Q9CWX9 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ddx47Q9CWX9 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Ddx47Q9CWX9 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Ddx47Q9CWX9 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx47Q9CWX9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx47Q9CWX9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx47Q9CWX9 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx47Q9CWX9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx47Q9CWX9 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx47Q9CWX9 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx47Q9CWX9 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx47Q9CWX9 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx47Q9CWX9 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx47Q9CWX9 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx47Q9CWX9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx47Q9CWX9 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx47Q9CWX9 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx47Q9CWX9 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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