Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Rprd1bQ9CSU0 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Rprd1bQ9CSU0 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Rprd1bQ9CSU0 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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