Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ifitm3Q9CQW9 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms