Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS8

Sec61b, Protein transport protein Sec61 subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec61bQ9CQS8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Gm11652-201ENSMUST00000117842 1267 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Kif2a-206ENSMUST00000159772 2570 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Gm37373-201ENSMUST00000194005 2812 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sec61bQ9CQS8 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Sec61bQ9CQS8 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Sec61bQ9CQS8 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Sec61bQ9CQS8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Sec61bQ9CQS8 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Sec61bQ9CQS8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Sec61bQ9CQS8 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Sec61bQ9CQS8 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Sec61bQ9CQS8 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Sec61bQ9CQS8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Sec61bQ9CQS8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Sec61bQ9CQS8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Sec61bQ9CQS8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Sec61bQ9CQS8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
Sec61bQ9CQS8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Sec61bQ9CQS8 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
Sec61bQ9CQS8 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Sec61bQ9CQS8 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Sec61bQ9CQS8 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Sec61bQ9CQS8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Sec61bQ9CQS8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Sec61bQ9CQS8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Sec61bQ9CQS8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Sec61bQ9CQS8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Sec61bQ9CQS8 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Sec61bQ9CQS8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
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