Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Chchd1Q9CQA6 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chchd1Q9CQA6 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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