Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chmp3Q9CQ10 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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