Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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