Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tsnaxip1Q99P25 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tsnaxip1Q99P25 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms