Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Gtf2ird2Q99NI3 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Gtf2ird2Q99NI3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Gtf2ird2Q99NI3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Gtf2ird2Q99NI3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Gtf2ird2Q99NI3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Gtf2ird2Q99NI3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Gtf2ird2Q99NI3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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