Protein–RNA interactions for Protein: Q99MS4

Prss29, Serine protease 29, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss29Q99MS4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Prss29Q99MS4 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prss29Q99MS4 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prss29Q99MS4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prss29Q99MS4 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Prss29Q99MS4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prss29Q99MS4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prss29Q99MS4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Prss29Q99MS4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prss29Q99MS4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Prss29Q99MS4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prss29Q99MS4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prss29Q99MS4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prss29Q99MS4 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prss29Q99MS4 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prss29Q99MS4 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prss29Q99MS4 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prss29Q99MS4 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prss29Q99MS4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prss29Q99MS4 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prss29Q99MS4 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prss29Q99MS4 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prss29Q99MS4 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prss29Q99MS4 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prss29Q99MS4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prss29Q99MS4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prss29Q99MS4 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prss29Q99MS4 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prss29Q99MS4 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prss29Q99MS4 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prss29Q99MS4 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prss29Q99MS4 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prss29Q99MS4 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prss29Q99MS4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prss29Q99MS4 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prss29Q99MS4 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prss29Q99MS4 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prss29Q99MS4 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prss29Q99MS4 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prss29Q99MS4 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prss29Q99MS4 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prss29Q99MS4 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prss29Q99MS4 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms