Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Nus1Q99LJ8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nus1Q99LJ8 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms