Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnpo2Q99LG2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnpo2Q99LG2 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnpo2Q99LG2 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnpo2Q99LG2 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnpo2Q99LG2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnpo2Q99LG2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnpo2Q99LG2 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms