Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed9Q99KF1 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmed9Q99KF1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmed9Q99KF1 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmed9Q99KF1 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmed9Q99KF1 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmed9Q99KF1 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmed9Q99KF1 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmed9Q99KF1 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmed9Q99KF1 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmed9Q99KF1 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmed9Q99KF1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmed9Q99KF1 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmed9Q99KF1 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed9Q99KF1 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed9Q99KF1 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed9Q99KF1 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed9Q99KF1 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmed9Q99KF1 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms