Protein–RNA interactions for Protein: Q99KC7

Smagp, Small cell adhesion glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmagpQ99KC7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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SmagpQ99KC7 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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SmagpQ99KC7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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SmagpQ99KC7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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SmagpQ99KC7 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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SmagpQ99KC7 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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SmagpQ99KC7 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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SmagpQ99KC7 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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SmagpQ99KC7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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SmagpQ99KC7 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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SmagpQ99KC7 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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SmagpQ99KC7 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SmagpQ99KC7 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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