Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Cldn16Q925N4 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Cldn16Q925N4 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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