Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC8□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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SptssbQ925E8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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SptssbQ925E8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Ar-201ENSMUST00000052837 10048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
SptssbQ925E8 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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