Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smg8Q8VE18 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smg8Q8VE18 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smg8Q8VE18 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smg8Q8VE18 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Smg8Q8VE18 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smg8Q8VE18 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smg8Q8VE18 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smg8Q8VE18 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smg8Q8VE18 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smg8Q8VE18 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smg8Q8VE18 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smg8Q8VE18 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smg8Q8VE18 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smg8Q8VE18 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smg8Q8VE18 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smg8Q8VE18 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smg8Q8VE18 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smg8Q8VE18 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smg8Q8VE18 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smg8Q8VE18 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Smg8Q8VE18 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smg8Q8VE18 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smg8Q8VE18 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smg8Q8VE18 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smg8Q8VE18 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smg8Q8VE18 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smg8Q8VE18 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smg8Q8VE18 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smg8Q8VE18 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smg8Q8VE18 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smg8Q8VE18 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smg8Q8VE18 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smg8Q8VE18 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smg8Q8VE18 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smg8Q8VE18 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smg8Q8VE18 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Smg8Q8VE18 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smg8Q8VE18 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smg8Q8VE18 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smg8Q8VE18 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smg8Q8VE18 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Smg8Q8VE18 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smg8Q8VE18 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smg8Q8VE18 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smg8Q8VE18 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smg8Q8VE18 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Smg8Q8VE18 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smg8Q8VE18 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Smg8Q8VE18 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smg8Q8VE18 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smg8Q8VE18 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smg8Q8VE18 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smg8Q8VE18 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smg8Q8VE18 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smg8Q8VE18 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smg8Q8VE18 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smg8Q8VE18 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smg8Q8VE18 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smg8Q8VE18 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Smg8Q8VE18 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smg8Q8VE18 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Smg8Q8VE18 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smg8Q8VE18 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smg8Q8VE18 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smg8Q8VE18 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smg8Q8VE18 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Smg8Q8VE18 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smg8Q8VE18 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smg8Q8VE18 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smg8Q8VE18 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smg8Q8VE18 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Smg8Q8VE18 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smg8Q8VE18 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smg8Q8VE18 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smg8Q8VE18 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smg8Q8VE18 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smg8Q8VE18 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smg8Q8VE18 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smg8Q8VE18 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smg8Q8VE18 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smg8Q8VE18 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smg8Q8VE18 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smg8Q8VE18 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Smg8Q8VE18 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Smg8Q8VE18 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Smg8Q8VE18 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smg8Q8VE18 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smg8Q8VE18 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smg8Q8VE18 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smg8Q8VE18 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smg8Q8VE18 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smg8Q8VE18 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smg8Q8VE18 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smg8Q8VE18 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smg8Q8VE18 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smg8Q8VE18 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smg8Q8VE18 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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