Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms