Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms