Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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Ubxn4Q8VCH8 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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Ubxn4Q8VCH8 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Ubxn4Q8VCH8 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Ubxn4Q8VCH8 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Ubxn4Q8VCH8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Ubxn4Q8VCH8 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Ubxn4Q8VCH8 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Ubxn4Q8VCH8 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ubxn4Q8VCH8 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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