Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms