Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top1mtQ8R4U6 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top1mtQ8R4U6 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top1mtQ8R4U6 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top1mtQ8R4U6 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top1mtQ8R4U6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top1mtQ8R4U6 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Top1mtQ8R4U6 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top1mtQ8R4U6 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top1mtQ8R4U6 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top1mtQ8R4U6 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top1mtQ8R4U6 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top1mtQ8R4U6 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top1mtQ8R4U6 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Top1mtQ8R4U6 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Top1mtQ8R4U6 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top1mtQ8R4U6 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top1mtQ8R4U6 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Top1mtQ8R4U6 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top1mtQ8R4U6 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top1mtQ8R4U6 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Top1mtQ8R4U6 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Top1mtQ8R4U6 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Top1mtQ8R4U6 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Top1mtQ8R4U6 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top1mtQ8R4U6 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Top1mtQ8R4U6 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top1mtQ8R4U6 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top1mtQ8R4U6 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top1mtQ8R4U6 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top1mtQ8R4U6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top1mtQ8R4U6 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top1mtQ8R4U6 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top1mtQ8R4U6 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top1mtQ8R4U6 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Top1mtQ8R4U6 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Top1mtQ8R4U6 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Top1mtQ8R4U6 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Top1mtQ8R4U6 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Top1mtQ8R4U6 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top1mtQ8R4U6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top1mtQ8R4U6 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top1mtQ8R4U6 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top1mtQ8R4U6 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top1mtQ8R4U6 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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