Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
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Hoxc12Q8K5B8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Hoxc12Q8K5B8 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
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Hoxc12Q8K5B8 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Hoxc12Q8K5B8 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Hoxc12Q8K5B8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Hoxc12Q8K5B8 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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