Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OptnQ8K3K8 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OptnQ8K3K8 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms