Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms