Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ssh3Q8K330 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
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