Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud6bQ8K2H2 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms