Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Trim68Q8K243 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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Trim68Q8K243 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Trim68Q8K243 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Trim68Q8K243 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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